Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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