Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SP140Q13342 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SP140Q13342 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP140Q13342 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SP140Q13342 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SP140Q13342 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SP140Q13342 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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