Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM28Q13263 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM28Q13263 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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