Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CALCOCO2Q13137 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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