Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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IFT88Q13099 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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IFT88Q13099 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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IFT88Q13099 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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