Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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