Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN1Q12860 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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