Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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