Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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