Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPAL4Q0D2K0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms