Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms