Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms