Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms