Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms