Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLE4Q04727 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLE4Q04727 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms