Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms