Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPD2P62316 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms