Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP7P55210 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP7P55210 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP7P55210 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP7P55210 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP7P55210 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP7P55210 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms