Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRPF1P55201 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms