Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms