Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBX2P52951 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBX2P52951 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms