Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC3P51654 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC3P51654 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms