Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms