Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX2P50458 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX2P50458 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX2P50458 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX2P50458 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms