Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms