Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARCN1P48444 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms