Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms