Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms