Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms