Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms