Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDH1P40925 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDH1P40925 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms