Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP62P37198 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP62P37198 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms