Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LTBRP36941 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LTBRP36941 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LTBRP36941 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms