Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms