Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA3P35244 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA3P35244 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPA3P35244 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms