Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms