Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP6P35125 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP6P35125 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP6P35125 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP6P35125 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP6P35125 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms