Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD40LGP29965 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms