Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB3P28472 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms