Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4AP27815 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms