Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms