Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL8A2P25067 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms