Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

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Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNCP24821 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNCP24821 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNCP24821 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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