Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF4P23510 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms