Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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