Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALB2P22676 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALB2P22676 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALB2P22676 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALB2P22676 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALB2P22676 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALB2P22676 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALB2P22676 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALB2P22676 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms