Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms