Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms