Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD53P19397 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD53P19397 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD53P19397 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD53P19397 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD53P19397 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD53P19397 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD53P19397 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD53P19397 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms