Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EGR1P18146 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR1P18146 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EGR1P18146 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms